產生免疫不孕癥的原因有二，一是有時輸精管阻塞，精液反溢到外面組織，外溢的精液使自身產生對抗精子的抗體(即自身免疫)，凡對這種抗原一抗體反應強烈的男子，因自身精子互相凝集失去活性，就不能使女方受孕；二是精子進入女性生殖道，引起抗原一抗體反應，產生對抗精子的抗體，使精子凝集，不能受孕。多數人精子抗原性不大，不會影響生育。但個別婦女對精子抗原性反應特別敏感，或男子自身對精子抗原性過于強烈，均可產生不孕。

目前，已根據免疫不孕癥發生的原理，制成了免疫避孕疫苗，給男子注射，通過免疫反應，降低精子活力，或給女子注射，以提高女子對精子抗原反應的敏感性，達到避孕的目的。這就是最近出現的一種新的避孕法——免疫避孕法。

由男性免疫機制引起的不育癥，是指由于諸種原因，造成的免疫耐受機制破裂，在男性的血液、精漿和精子表面發生免疫應答，產生了抗精子抗體(AsAb)，精子會發生頭對頭、尾對尾或混合凝集現象，影響受孕而導致不育癥。AsAb的滴度越高，精子發生凝集和停止運動的現象越嚴重。大約10%不育男子發現有 AsAb，其發病率占所有不育夫婦病因的3%左右。

中西醫談發病原因：

1、西醫觀點：

常見：血-睪屏障破壞(輸精管結扎、輸精管吻合術、精子肉芽腫、輸精管梗阻、睪丸活檢、生殖道損傷、生殖道感染、附睪癥、精索靜脈曲張等)，免疫抑制功能障礙，遺傳及其他因素。

2、中醫觀點：

中醫認為本病病位主要在肝腎，其次在肺脾，病因之本為體虛，標為損傷和外邪侵襲。病機主要是正虛邪實，因此，臨床治療以扶正祛邪為原則。